Kesempatan permagangan yang ada di Merapi Farma Herbal ini dilakukan oleh beberapa sekolah menengah kesehatan, sekolah tinggi ilmu kesehatan, politeknik kesehatan dan perguruan tinggi baik negeri maupun swasta. Para siswa dan mahasiswa magang ini secara intensif melakukan proses pemagangan di Merapi Farma Herbal untuk secara lebih mendalam mempelajari jamu dan tanaman obat herbal.
Program pemagangan tersebut meliputi beberapa bidang sesuai bidang yang ada di Merapi Farma Herbal antara lain:
Divisi Produksi merupakan divisi yang melakukan proses produksi, yang dimulai dari pencucian simplisia (bahan jamu kering), pemotongan atau perajangan, pengeringan, sortasi, peracikan dan pengepakan.
Divisi Marketing merupakan divisi yang mengurusi pemasaran hasil produksi. Divisi marketing ini berupa kedai-kedai yang menjual jamu langsung minum dan racikan jamu dalam kemasan dan dapat pula berupa wisata Argo.
Divisi Agrowisata merupakan divisi yang mengurusi tentang budidaya dan pembibitan tanaman obat/ bahan baku produksi. Pada Divisi Agrowisata ini juga menjual hasil produksi yang berupa jamu godok siap minum, jamu racikan dalam kemasan, penjualan bibit tanaman jamu dan sebagai tempat pengenalan tanaman obat, jamu dan CV Merapi Farma Herbal Yogyakarta.
Diantara beberapa lembaga pendidikan yang sudah melakukan permagangan yaitu:
- Poltekkes Kementerian Republik Indonesia Surakarta.
- Universitas Kristen Duta Wacana Yogyakarta.
- SMK Kesehatan Insan Mulia Yogyakarta.
- Politeknik Kesehatan Bhakti Setya Indonesia (BSI) Yogyakarta.
- Stikes Al-Irsyad Al-Islamiyah Cilacap Jawa Tengah.
- SMK Kesehatan Bantul Yogyakarta.